近日,我院张露教授研究团队在红花香椿(Toona fargesii A. Chev.)研究中取得了重要进展,该研究基于PacBio和Illumina测序并结合Hi-C技术,将红花香椿基因组组装到了28条染色体,获得了535.24 Mb的染色体级别高质量参考基因组,红花香椿含有171个特有基因家族和3091个单拷贝基因,特别是ARR基因家族得到显著扩张并在根萌组织中显著表达。转录组分析揭示,根萌组织与非根萌组织在细胞分裂素代谢通路中存在显著差异表达基因,可能通过ARR基因调控WUS和YUCCA等基因,以调控特定组织内的生长素和细胞分裂素水平,促进形成层细胞的分化和根萌组织的生成。本研究以“Chromosome‐scale genomes of Toona fargesii A. Chev. provide insights into competency of root sprouting”为题发表在《Journal of Systematics and Evolution》,揭示了红花香椿染色体级别基因组,深入探讨了根萌的生成机制,为红花香椿濒危机制解析和其保护繁殖提供了重要见解。马际凯博士和程强强博士(现为江西林科院副研究员)为共同第一作者。张露教授、国春策青年教授和南京林业大学曹福亮院士为共同通讯作者。
图1 红花香椿的形态特征
图2 红花香椿的比较基因组学分析
论文链接: http://doi.org/10.1111/jse.13144
供稿:马际凯 审核:陈伏生 刘纯青